1949年

3月 赴北平参加中国人民解放军第四野战军高级干部会议。

5月10日 受到毛泽东接见，毛泽东对东北抗联斗争给予高度评价。

9月 被选为全国人民政协会议东北区代表，出席中国人民政治协商会议。

9月14日 奉调到云南省工作。

10月1日 参加中华人民共和国开国大典。

1950年

2月24日 中共云南省委成立，任委员。

3月24日 云南省人民政府成立，主席陈赓，副主席周保中、张冲、杨文清。同日，中央人民政府政务院任命卢汉为云南省军政委员会主任，宋任穷、周保中为副主任。

6月18日 中共中央电令陈赓代表中央前往越南，帮助越南人民抗击法国殖民主义者。之后由其主持云南省人民政府全面工作。

12月25至翌年1月2日 云南省第一次各族各界人民代表会议在昆明召开，代表省人民政府作《云南省人民政府工作报告》。

1951年

4月15日 参加云南省各界人民代表大会，镇压惩治反革命罪犯。宣布将杀害杨虎城将军的匪首李家杰等，杀害李公仆、闻一多的凶犯袁炳南等以及“一二一”等惨案的首恶分子36名罪犯判处死刑，执行枪决。

8月1日 中共云南省委批准成立云南省民族学院，兼院长。

12月21日 丽江、鹤庆、剑川等县发生6.2级强烈地震。组织赈灾委员会，次日赶赴灾区，领导抗震救灾工作。

1952年

7月 云南连日降大雨，发生洪灾，亲临防洪第一线领导抗洪工作。

11月 调任西南军政委员会（后改为西南行政委员会）政法委员会主任，兼民政部部长。

1953年

7月 兼任西南政法学院党组书记。

1954年

2月  西南军区司令员贺龙给周恩来打电报，报告周保中的病情。月底，周恩来派专机将周保中接到北京治病，住进北京医院。

9月 当选为第一届全国人民代表大会代表。出席第一届全国人民代表大会第一次会议。

12月 当选为中国人民政治协商会议第二届全国委员会委员。

12月22日 在北京颐和园与前来中国访问的朝鲜党和国家领导人金日成首相相会。

1955年

本年 撰写回忆东北抗日联军史料文稿20余万字，口述抗联史50余万字。

同年 荣获国家授予的三个一级勋章。

1956年

9月 在中国共产党第八次全国代表大会上，当选为中共中央候补委员。

11月 出席中共中央统战部召开的纪念西安事变20周年座谈会。

1957年

12月 修改《杨靖宇将军生平事迹》一文，形成定稿。

1958年

2月23日 在吉林通化，参加抗日民族英雄杨靖宇公祭纪念大会。

1959年

4月 当选为第二届全国人民代表大会代表、中华人民共和国国防委员会委员和中国人民政治协商会议第三届全国委员会委员和常务委员。

12月28日 向东北来访人员回忆和提供东北党组织和抗联的历史资料。

1960年

2月3日 撰写《松柏常青——纪念杨靖宇同志逝世二十周年》一文。

9月9日 与东北来访人员谈东北14年抗日游击战争的历史地位、评价和教训等问题。

本年 撰写《忆东北抗日游击战争》。

1962年

11月10日 与东北来访人员谈东北抗联第五军历史。

1963年

6月9日 陪同周恩来总理等会见朝鲜民主主义人民共和国最高人民会议常任委员会委员长崔庸健等贵宾。

6月27日 致信家乡亲友杜秀清，希望在家乡多给青年人以指点，使他们努力参加社会主义建设，尊重集体主义和集体利益。

1964年

2月22日 在北京病逝。