1946年

4月，撰写《关于目前国际形势的几点估计》。

6月26日，国民党军大举进攻中原解放区，全面内战爆发。

7月4日，作出南线野战军“先在内线打几个胜仗再转至外线”的战略决策。

7月20日，起草《以自卫战争粉碎蒋介石的进攻》的党内指示。

8月6日，会见美国记者斯特朗，提出“一切反动派都是纸老虎”的著名论断。

9月16日，为中共中央军委起草《集中优势兵力，各个歼灭敌人》的指示。

10月1日，为中共中央起草党内指示，总结三个月战争的经验。

11月18日，在为中共中央起草的党内指示中，第一次使用“人民解放战争”的名称。

1947年

3月18日，率中共中央机关和人民解放军总部撤离延安，开始历时一年的陕北转战。

3月至8月，领导西北野战军先后取得青化砭、羊马河、蟠龙、沙家店战役的胜利，粉碎了国民党对陕北解放区的重点进攻。

7月21日至23日，在陕北靖边县小河村主持召开中共中央会议，提出对蒋介石的斗争用五年时间（从1946年7月算起）解决的设想。在此前后，部署刘邓、陈粟、陈谢三路大军渡过黄河，转入战略进攻。

10月，起草《中国人民解放军宣言》，提出“打倒蒋介石，解放全中国”的口号。

11月，将1933年起草的《怎样划分阶级》和《关于土地斗争中一些问题的决定》重新印发给全党，以指导解放区土改运动正确发展。

12月25日至28日，在陕北米脂县杨家沟主持召开中共中央会议（即十二月会议），向会议提交《目前形势和我们的任务》的书面报告，提出了十大军事原则和新民主主义的三大经济纲领。

1948年

1月18日，为中共中央起草《关于目前党的政策中的几个重要问题》的决定草案。

3月23日，结束陕北转战，东渡黄河，前往华北解放区。

4月1日，在山西兴县蔡家崖晋绥干部会议上发表重要讲话，阐明党的新民主主义革命总路线和土地改革总路线。

4月30日至5月7日，在河北阜平县城南庄主持召开中共中央书记处扩大会议，提出把战争引向国民党统治区、发展生产、加强纪律性等几点意见。

5月1日，致信李济深、沈钧儒，提出成立民主联合政府，宜先行召开新的政治协商会议。

5月27日，到达中共中央工委所在地河北平山县西柏坡村。

9月8日至13日，在西柏坡主持召开中共中央政治局会议，作关于战争、建国、财经等问题的重要报告。

9月至次年1月，组织指挥辽沈、淮海、平津三大战略决战，将国民党军主力聚歼在长江以北。

12月30日，为新华社写一九四九年新年献词《将革命进行到底》。

1949年

3月，主持召开中共七届二中全会，提出实现党的工作重心转移、夺取全国胜利以及关于新中国建设的指导方针和基本政策。

3月25日，率中共中央机关和人民解放军总部进驻北平。

4月21日，在南京政府拒绝接受《国内和平协定》的情况下，和朱德联名发布《向全国进军的命令》。

4月23日，人民解放军占领南京，作诗《七律·人民解放军占领南京》。

6月15日至19日，出席新政协筹备会议第一次全体会议，并在开幕式上讲话。

6月30日，发表《论人民民主专政》一文。

7月4日，复电程潜，对程提出的反蒋反桂及和平解决湖南问题之方针，给予赞许，并对有关事宜作出安排。

9月21日至30日，出席中国人民政治协商会议第一届全体会议，致开幕词，当选中央人民政府主席。会议通过了由周恩来主持起草、经他多次审阅修改的《共同纲领》。

10月1日，中华人民共和国成立，主持开国大典。

12月5日，颁发《关于一九五○年军队参加生产建设工作的指示》。

12月16日，抵达莫斯科，首次访问苏联。1950年2月14日，中苏签署《中苏友好同盟互助条约》。

12月至翌年初，对和平解放西藏作出具体部署。

1950年

6月6日至9日，主持召开中共七届三中全会，提交《为争取国家财政经济状况的基本好转而斗争》的书面报告，并作《不要四面出击》的讲话。

6月28日，主持召开中央人民政府委员会第八次会议，通过《中华人民共和国土地改革法》。

10月上旬，主持中共中央政治局会议，作出“抗美援朝，保家卫国”的决策。

10月8日，发布组成中国人民志愿军的命令，命令志愿军迅即向朝鲜境内出动，援助朝鲜人民，并任命彭德怀为志愿军司令员兼政治委员。随后亲自指导了第一次至第三次战役。

10月以后，发动和领导了镇压反革命运动。