黑龙江省有黑龙江、松花江、乌苏里江和绥芬河四个水系，有兴凯湖、镜泊湖和五大连池三处湖泊以及星罗棋布的泡沼。全省流域面积50平方公里以上的河流有1，918条，多年平均径流深为141.8毫米，折合年径流量643.8亿立方米。地下水总补给量为262.9亿立方米。全省水资源总量（包括地表水、地下水，扣除重复部分）为762.08亿立方米。此外，全省入境地表水量为1，610亿立方米，出境水量为1，081亿立方米。全省河流理论蕴藏量为844万千瓦，可开发利用水力资源为612.3万千瓦。